豬或其他動物在吞食了小袋蟲的包囊而感染結(jié)腸小袋蟲病，囊壁經(jīng)消化液的作用后，蟲體逸出變?yōu)樽甜B(yǎng)體，進(jìn)入大腸定居。以腸壁細(xì)胞、淀粉、細(xì)菌、糞便中的碳水化合物、紅細(xì)胞和白細(xì)胞等為營養(yǎng)。以橫二分裂法進(jìn)行繁殖。在不利環(huán)境或其他條件下，滋養(yǎng)體形成包囊。宿主的糞便中常有許多小袋蟲的滋養(yǎng)體和包囊，宿主吞食了散播在外界環(huán)境中的包囊而遭受豬結(jié)腸小袋蟲病感染。

 　 豬結(jié)腸小袋蟲病人的感染率很低。人的感染主要是吞食被包囊污染的食物和水引起的。包囊對外界環(huán)境有較強(qiáng)的抵抗力，在室溫下至少可保持活力2周；在潮濕的環(huán)境下能存活2個(gè)月；在直射陽光下3h才能發(fā)生死亡。在10%的福爾馬林溶液中能存在4小時(shí)。

該病有急性和慢性兩種類型，急性型多突然發(fā)病，可于2～3日發(fā)生死亡。慢性型可持續(xù)數(shù)周至數(shù)月。

患豬表現(xiàn)精神沉郁，食欲減退或廢絕，喜躺臥，有顫抖現(xiàn)象，體溫有時(shí)升高；腹瀉為最常見的癥狀，糞便先為半稀，后水瀉，帶有黏膜碎片和血液，并有惡臭。重癥病豬可發(fā)生死亡。仔豬發(fā)病嚴(yán)重；成年豬常為帶蟲者，常常成為豬結(jié)腸小袋蟲病感染源。